Présentation
Il n'était pas à la rencontre OSIDEAL...
La rencontre OSIDEAL aura lieu le mercredi 28 avril 2010 de 13h30 à 18h
dans la Salle du Conseil de
Polytech' Montpellier
sur le campus Triolet de l'
Université Montpellier 2
par l'
Association Contact.
Elle réunira des
doctorants en informatique et statistiques
d'une part, en
agronomie et environnement d'autre part.
Son objectif est de
resserrer les liens entre ces deux communautés
de jeunes chercheurs, dans le contexte de la mise en valeur des
pôles régionaux de l'Eau et de l'Agronomie.
En début d'après-midi, des doctorants présenteront des
outils et des problématiques
de recherche à l'interface des disciplines concernées.
Des
problématiques en environnement et agronomie qui nécessitent
la création de nouveaux outils, et des
expériences de collaborations pluridisciplinaires fructueuses
seront alors présentées par des doctorants. Enfin une table ronde réunissant
des créateurs d'entreprises, institutionnels et chercheurs permettra
de
présenter des entreprises innovantes qui utilisent ou développent
des outils informatiques et statistiques pour des problématiques environnementales
ou agronomiques. L'événement se terminera par un cocktail.
Pour y participer, il suffit de vous inscrire ci-dessous.
Vous pouvez proposer une présentation d'une vingtaine de minutes,
ou un témoignage de collaboration scientifique interdisciplinaire,
à
l'équipe d'organisation sur osidX@lirmm.fr (enlevez le "X").
Programme
Il était à la rencontre OSIDEAL...
- 13h30 - Accueil des participants et introduction de la rencontre.
- 13h45 - Présentations de doctorants en Informatique et Statistique :
- Tristan Allouis :
R : un outil de programmation polyvalent
La visualisation, le traitement ainsi que la réorganisation de données
volumineuses est coûteuse en temps de calcul. Les tableurs classiques
(Excel, OpenOffice Calc) sont d'ailleurs incapables de traiter plus de 65000
lignes. Au contraire, le logiciel libre "R" est un excellent outil
conçu pour l'analyse statistique de données volumineuses. De plus, de
nombreux packages accroissent ses possibilités d'utilisation, comme pour
la manipulation de données géographiques. Il permet aussi de programmer
ses propres fonctions d'une manière très simple comparée aux langages de
plus bas niveaux (C, C++), tout en conservant de très bonnes performances.
- Marie Denis :
Filtrage particulaire
L'inférence bayésienne est de plus en plus utilisée pour traiter les
données environnementales. En effet, celle-ci s'applique bien à des
données peu nombreuses et bruitées. Lors de cet exposé, nous
expliquerons comment les méthodes de filtrage particulaire peuvent être
proposées comme alternative aux méthodes MCMC plus traditionelles, pour
approximer la loi a posteriori des observations. Nous présenterons des
applications sur des données de pêcherie et foresterie.
- Khader Khadraoui :
Modélisation markovienne
de la dynamique spatio-temporelle des forêts
Les forêts sont des systèmes écologiques d'une grande complexité. Les
phénomènes d'interaction associés à une forêt sont dûs à la compétition
entre les individus de la même espèce mais aussi entre individus d'espèces
différentes. Cette compétition porte sur l'accès aux ressources (nutriments,
lumière, l'eau, ,...). Les échelles des écosystèmes forestiers sont très
longues. Pour cette raison, nous utilisons dans ce travail la modélisation
markovienne pour la distribution spatiale des individus. Le modèle considéré
est sous la forme d'un modèle individu-centré. Nous étudions les
propriétés de ce modèle moyennant un processus stochastique de branchement.
- 14h45 - Pause café et discussions
- 15h00 - Présentations de doctorants en Informatique et Statistique :
- Julien Rabatel :
Fouille de données de capteurs
Les études liées à l'environnement ou à l'agronomie s'appuient
fréquemment sur des données issues de capteurs. Dans ce contexte, de
nombreuses difficultés inhérentes à l'exploitation de telles données
apparaissent.
Au cours de cet exposé, nous nous intéresserons à l'emploi de techniques
de fouille de données afin d'extraire des connaissances utiles dans les
informations fournies par les capteurs. Nous verrons également comment
les connaissances ainsi acquises peuvent être utilisées dans le but de
répondre à différentes problématiques telles que, par exemple, la
détection d'anomalies ou la prédiction.
- Nathalie Saint-Geours :
Analyse de sensibilité d'un modèle spatialisé
Le développement de modèles spatialisés complexes pour l'aide
à la décision est aujourd'hui monnaie courante : ces modèles visent à
synthétiser des données environnementales nombreuses et variées pour
calculer des indicateurs qui puissent aider au pilotage de politiques
publiques. Ces outils sont notamment utilisés pour l'aide à la décision
dans la gestion des risques naturels. L'évaluation de leur fiabilité
s'effectue grâce à des méthodes d'analyse d'incertitude et de
sensibilité. Nous présenterons une démarche d'analyse de sensibilité
dite "de Sobol" sur un outil d'évaluation économique du risque
d'inondation (Analyse Coût Bénéfice-Dommages Evités) développé par le
CEMAGREF.
- Florian Salipante :
Nouvelle méthode statistique pour
l'analyse de données de ChIP-chip
Dans ce travail, nous considérons une longue série d'observations
numériques. Nous nous intéressons aux "pics" de valeurs, qui sont des
événements rares et significatifs. Il s'agit alors de définir un seuil
adéquat. Pour cela, nous développons des méthodes issues de la théorie
des valeurs extrêmes. Nous illustrons notre approche sur des des données
issues de puces à ADN, cependant notre méthode se transpose aisément aux
cas d'observations nombreuses et bruitées.
- 16h00 - Pause café et discussions.
- 16h15 - Présentations des doctorants en Environnement et Agronomie :
- Virginie Mfegue - Dynamique spatio-temporelle de la pourriture
brune des cabosses du cacaoyer en parcelles paysannes au Cameroun
La pourriture brune des cabosses est la contrainte sanitaire majeure de la production cacaoyère en Afrique. Au Cameroun, elle est causée par Phytophthora megakarya et cause des pertes de l'ordre de 50 à 80% de la production potentielle.
Des études antérieures ont mis en évidence la présence de foyers d'infections au sein des parcelles, qui sont des points de départ permanent et de forte incidence de la maladie au cours de la campagne.
La présente étude se propose de suivre la progression de la maladie sur 2 années consécutives et dans 4 cacaoyères situées dans 2 zones agro écologiques distinctes (forêt et savane). Les données récoltées à un rythme hebdomadaire sont de nature sanitaire (cabosses infectées ou saines). Elles sont complétées par une caractérisation des parcelles (arbres d'ombrage, densité).
L'hypothèse est qu'une prédiction de la progression de l'épidémie permettrait de circonscrire les traitements phytosanitaires aux seules zones de forte incidence de la maladie, et ainsi d'en limiter le coût et l'incidence sur l'environnement.
Une première analyse à l'aide du logiciel GSWin a permis de suivre l'épidémie et de mettre en évidence des zones d'agrégation de la maladie au sein des parcelles. Cependant, cette étude doit être validée, ce logiciel n'ayant jamais été utilisé pour ce type d'analyse par le passé.
Il s'agit donc de définir des outils d'analyse géostatistique appropriés pour cette étude et de discuter des avantages et limites de GSWin.
- Discussion sur les besoins en outils informatiques et statistiques
des doctorants en Environnement et Agronomie.
- 17h15 - Table ronde sur la création d'entreprise, avec la participation
de Lorène Milliex de Languedoc-Roussillon Incubation,
et de Didier Breton de Nevantropic.
- 17h45 - Conclusion de la rencontre.
- 18h00 - Cocktail de l'interdisciplinarité.
Inscription
Pour participer gratuitement à cette rencontre,
inscrivez-vous ici !
Accès à la salle du Conseil Polytech'
La salle du Conseil de Polytech' se trouve sur le
campus du Triolet à proximité de l'arrêt
Universités des Sciences et des Lettres de la ligne 1 de tramway
(direction Mosson depuis la gare de Montpellier). Elle est
dans le bâtiment 31.
Plan d'accès à l'Université Montpellier 2.
Partenaires
Cette rencontre organisée par l'association
Contact des doctorants et docteurs
de l'académie de Montpellier a le soutien financier des écoles doctorales
I2S
et
SIBAGHE
ainsi que l'
OSU-OREME.
Polytech' Montpellier
accueille l'événement sur le campus Triolet de
l'
Université Montpellier 2.
L'école doctorale
E2
ainsi qu'
Agropolis International
nous ont soutenu en diffusant l'information sur l'événement.
Prolongations
Un bilan de la rencontre a été publié sous forme d'
article
dans le numéro de mai 2010 du journal
Quoi d'neuf doc' ?
de l'association Contact.
Un
espace protégé
contenant les coordonnées des participants à la rencontre,
dont les codes d'accès se trouvent dans le programme distribué
pendant la rencontre, a été
mis en place
pour poursuivre les contacts initiés lors de l'événement.
Contacts
Equipe d'organisation :
